دانشگاه آرل دارای بیش از یک مرکز تحقیقاتی اختصاصی برای هر یک از رشته‌های دانشکده‌های خود است. از برجسته‌ترین این مراکز می‌توان به موارد زیر اشاره کرد:

• مرکز کاربردها و تحقیقات مطالعات هوش مصنوعی
• مرکز کاربردها و تحقیقات روان‌شناسی
• مرکز تحقیقات مالی

این دانشگاه دارای بیش از 60 آزمایشگاه و مرکز تحقیقاتی مختلف است، از جمله آزمایشگاه‌های مهندسی محصولات، مهندسی عمران و مکانیک، و همچنین آزمایشگاه‌های زیست‌شناسی مولکولی، علم ژنتیک و شیمی، و دیگر رشته‌ها.